GraphPad Prism9是一款知名的科研医学生物数据处理绘图软件,中文名叫棱镜,可以准确地对各种数据进行分析,最后汇总成各种图表样式。最大的优点就是入门简单,功能强大,为用户提供了结合科学作图、综合曲线拟合等强大功能,大大提高用户的工作效率。
软件特色
1、有效地整理数据
Prism是专门为要运行的分析设置的格式,包括对定量和分类数据的分析。这样可以更轻松地正确输入数据,选择合适的分析以及创建精美的图形。
2、进行正确的分析
避免使用统计术语。用清晰的语言,Prism提供了一个广泛的分析库,从普通检验到高度特定的检验– t检验,单向,双向和三向方差分析,线性和非线性回归,剂量反应曲线,二进制逻辑回归,生存分析,主要成分分析等等。每个分析都有一个清单,以帮助您了解所需的统计假设并确认您选择了适当的测试。
3、一键回归分析
没有其他程序可以像Prism那样简化曲线拟合。选择一个方程式,然后Prism进行其余工作-拟合曲线,显示结果和函数参数表,在图形上绘制曲线,并内插未知值。
4、专注于您的研究,而不是您的软件
Prism为您处理编码。图形和结果将自动实时更新。数据和分析的任何更改(直接输入数据,省略错误的数据,纠正错别字或更改分析选择)都将立即反映在结果,图形和布局中。
5、无需编程即可自动化您的工作
单击即可自动将多个成对比较添加到您的分析中。对于这些行和星号的自定义选项,只需再次单击工具栏按钮。调整数据或分析,图形上显示的结果将自动更新。
新功能
一、更高维度的数据!
Prism 9对多变量数据表进行了许多重大改进。使用标准结构探索更大的数据集,并通过以下改进执行新的和改进的分析:
1、增加的数据限制-在每个数据表中最多输入1024列数据
2、自动识别变量类型-将多变量数据表中的变量识别为连续值,分类值或标签值
3、数据表中的文本信息-直接以文本形式输入数据。无需编码“ 0”和“ 1”之类的变量,只需直接在数据表中输入“ Male”和“ Female”
4、自动变量编码-输入您的数据,让Prism负责其余的工作。Prism会自动将分类文本变量编码为数字“虚拟”变量
二、主成分分析(PCA)
有时,收集的变量数量远远超过可供研究的学科数量。考虑基因表达研究,其中从分为两组的受试者中测量了成百上千种不同基因的表达水平:治疗组和对照组。可能仅仅是变量太多而无法使模型适合数据。但是,选择一些要从分析中排除的变量只会丢掉可能有用的信息!PCA是一种“降维”技术,可用于减少所需变量的数量,同时从数据中消除尽可能少的信息。
PCA中可用的其他功能包括:
1、通过平行分析(以及Kaiser方法,总方差阈值方法等)选择组件
2、碎石图,分数图和双线图的生成
3、自动准备PCA结果以进一步用于多元线性回归(主成分回归)
三、向图形添加新尺寸
直接从原始数据,符号位置(X和Y坐标),大小和填充颜色的编码变量创建气泡图。请注意,可以使用分类(分组)或连续变量来定义符号颜色和符号大小。
在此图上,超过100个国家/地区显示为单个圆圈。每个圆圈的X坐标代表该国的GDP(PPP),而Y坐标代表出生时的平均预期寿命。每个符号的大小与其所代表的国家的人口成比例(两个最大的符号分别代表中国和印度)。最后,每个符号的颜色代表该国家所在的大陆。在这种情况下,此最终变量(颜色)是分类变量,但气泡图中的颜色也可以由连续变量定义:在该图中,符号的X坐标,Y坐标和大小与以前相同。但是,现在该符号的颜色连续不断地代表该国家每1000个人的出生率。棱镜现在还具有内置的半透明配色方案,以便可以更清晰地看到重叠的符号。
四、自动将多个比较结果添加到图形!
只需执行多个成对比较的适当分析即可。然后单击一次以将这些结果自动添加到图形中。要自定义这些行和星号,只需再次单击工具栏按钮。调整数据或分析,图形上显示的结果将自动更新。但是请记住,P值只是故事的一部分。别忘了报告效果估算值(例如,均值差异为95%置信区间!)
五、使用估计图更好地可视化T测试结果
在测试中执行,Prism现在将自动创建结果的估计图。在此图上,两组的原始数据都将绘制在左侧的Y轴上。在右边的Y轴上,将绘制组均值的差及其95%置信区间。该可视化提供的信息比单独的P值还多,因为它不仅显示了95%CI是否包含零(如果95%CI包含零,则P值将大于0.05;它还显示了95%CI的宽度)。如果95%CI不包括零,则P值将小于0.05)